フィリップ・ジルベール（ベルギー＝ＢＭＣレーシング）が第１２ステージに続き、今大会２勝目を挙げた。

　逃げグループにいたジルベールは残り２０キロ付近で単独でアタックし、そのまま逃げきった。４７秒遅れの２位にフランチェスコ・ボンジョルノ（イタリア＝バルディアーニ・ＣＳＦ）、１分１秒遅れの３位にシルバン・シャバネル（フランス＝ＩＡＭ）が入った。

　オローニョ山手前で総合２、３位のミケル・ランダ（スペイン＝アスタナ）、ファビオ・アール（イタリア＝アスタナ）がクラッシュで遅れる中、総合首位のアルベルト・コンタドール（スペイン＝ティンコフ・サクソ）がアタックをかけ、トップから６分５秒遅れの１２位でゴール。アールとランダは７分１８秒遅れの集団でゴールし、タイム差は２位ランダと５分１５秒、３位アールとは６分５秒と開いた。

　コンタドールは「４カ月間、このレースで勝つために準備してきた。日に日に勝利に近づいている」と自信を見せた。

　ジルベールとともに逃げに加わっていたダミアーノ・クネゴ（イタリア＝ＮＩＰＰＯ・ビーニファンティーニ）は残り５５キロ付近で落車し、リタイアした。

　別府史之（トレックファクトリー）は２２分５１秒遅れの１５２位で、総合は３時間３３分４７秒遅れの１１３位。