3月19日に開幕するセンバツ大会の組み合わせ抽選会がオンラインで行われ、開幕戦の神戸国際大付（兵庫）－北海（北海道）など初戦の相手が決まった。
優勝候補の大阪桐蔭は智弁学園（奈良）と対戦。昨秋関東大会優勝の高崎健康福祉大高崎（群馬）は下関国際（山口）と対戦。プロ注目右腕・小園を擁する市和歌山は県岐阜商（岐阜）との対戦が決まった。なお選手宣誓は第1日第2試合に登場する仙台育英（宮城）に決まった。1回戦16試合の組み合わせは以下の通り。
【第1日】
▽第1試合：神戸国際大付－北海（午前10時）
▽第2試合：明徳義塾－仙台育英（午後0時40分）
▽第3試合：健大高崎－下関国際（午後3時20分）
【第2日】
▽第1試合：宮崎商－天理（午前9時）
▽第2試合：三島南－鳥取城北（午前11時40分）
▽第3試合：東海大相模－東海大甲府（午後2時20分）
【第3日】
▽第1試合：具志川商－八戸西（午前9時）
▽第2試合：福岡大大濠－大崎（午前11時40分）
▽第3試合：明豊－東播磨（午後2時20分）
【第4日】
▽第1試合：市和歌山－県岐阜商（午前9時）
▽第2試合：智弁学園－大阪桐蔭（午前11時40分）
▽第3試合：広島新庄－上田西（午後2時20分）
【第5日】
▽第1試合：東海大菅生－聖カタリナ学園（午前9時）
▽第2試合：柴田－京都国際（午前11時40分）
▽第3試合：常総学院－敦賀気比（午後2時20分）
【第6日】
▽第1試合：中京大中京－専大松戸（午前9時）
※第2試合から2回戦
