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関東学連
これまではオープン参加だったが、今大会から正式順位が付くことになった。１６人のメンバーのうち過去箱根に出場したのは２人だけ。しかし、予選会で１６位の外丸和輝（東農大１年）１７位の馬場圭太（帝京大２年）ら１、２年生に好選手が多く、本番でアっと驚く快走が見られるかもしれない。１６人の中に学習院大の川内優輝（２年＝春日部東）が入った。箱根を走れば同校からは初めての快挙となる。指揮を執るのは拓大監督の川内勝弘氏（３６）。
※年齢は２００６年12月20日現在のもの
| 区 | 選手名 | 年 | 所属校 | １万Ｍ公認タイム |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 外丸和輝 | 1 | 東農大 | ２９．２４．９０ |
| 2 | 四辻翼 | 1 | 上武大 | ２９．５６．００ |
| 3 | 佐藤雄治 | 2 | 平成国際大 | ２９．４１．６４ |
| 4 | 大城将範 | 3 | 筑波大 | ２９．１９．０２ |
| 5 | 涌井圭介 | 4 | 拓大 | ２９．１９．７３ |
| 6 | 川内優輝 | 2 | 学習院大 | ２９．２８．０４ |
| 7 | 小沢計義 | 4 | 関東学院大 | ２９．５０．９８ |
| 8 | 山田直弘 | 4 | 山梨大 | ２９．５６．７７ |
| 9 | 馬場圭太 | 2 | 帝京大 | ２９．１５．７５ |
| 10 | 米沢豪 | 2 | 青学大 | ２９．２１．４４ |
| 補 | 田吹隆一 | 4 | 平成国際大 | ２９．２５．８８ |
| 補 | 久野雅浩 | 3 | 拓大 | ２９．０８．６０ |
| 補 | 小田鎌徳 | 3 | 帝京大 | ２９．５１．２３ |
| 補 | 永田研治 | 3 | 玉川大 | ２９．５０．４０ |
| 補 | 坂本智史 | 2 | 関東学院大 | ３０．１８．７９ | 補 | 椎谷智弘 | 2 | 東農大 | ２９．２２．４２ |