3月19日に開幕するセンバツ高校野球の組み合わせ抽選会が行われ、1回戦の組み合わせが決まった。春連覇を目指す横浜（神奈川）は神村学園（鹿児島）、昨夏に続く夏春連覇を狙う沖縄尚学は帝京（東京）と対戦。21世紀枠の長崎西は滋賀学園、高知農は日本文理（新潟）と初戦を戦う。昨秋の明治神宮大会で優勝した九州国際大付（福岡）は同準優勝の神戸国際大付（兵庫）と対戦。決勝戦の再現となった。

選手宣誓は北照（北海道）の手代森煌斗主将が行うことが決まった。

組み合わせは以下の通り。

【第1日＝19日】

第1試合：帝京（東京）－沖縄尚学（沖縄）

第2試合：阿南光（徳島）－中京大中京（愛知）

第3試合：八戸学院光星（青森）－崇徳（広島）

【第2日＝20日】

第1試合：滋賀学園（滋賀）－長崎西（長崎＝21世紀枠）

第2試合：横浜（神奈川）－神村学園（鹿児島）

第3試合：花巻東（岩手）－智弁学園（奈良）

【第3日＝21日】

第1試合：東洋大姫路（兵庫）－花咲徳栄（埼玉）

第2試合：高知農（高知＝21世紀枠）－日本文理（新潟）

第3試合：北照（北海道）－専大松戸（千葉）

【第4日＝22日】

第1試合：神戸国際大付（兵庫）－九州国際大付（福岡）

第2試合：近江（滋賀）－大垣日大（岐阜）

第3試合：山梨学院（山梨）－長崎日大（長崎）

【第5日＝23日】

第1試合：東北（宮城）－帝京長岡（新潟）

第2試合：高川学園（山口）－英明（香川）

第3試合：三重（三重）－佐野日大（栃木）

【第6日＝24日】

第1試合：熊本工（熊本）－大阪桐蔭（大阪）

※第2試合以降2回戦