ドラフト会議は育成枠も含めすべての指名が終了した。高校生では高校通算62本塁打の広陵の「ボンズ」こと真鍋慧（けいた）内野手、U18高校日本代表の沖縄尚学・東恩納蒼投手、同じく履正社・森田大翔内野手らが指名漏れした。
大学生では大学日本代表の早大・熊田任洋内野手（東邦）、同じく明大・蒔田稔投手（九州学院）らが指名を受けなかった。
社会人では日本通運・平元銀次郎投手（法大）、三菱重工West・竹田祐投手（明大）らが指名漏れした。
主な指名漏れ選手は以下の通り。
＜高校生＞
広陵・真鍋慧内野手
沖縄尚学・東恩納蒼投手
履正社・森田大翔内野手
仙台育英・仁田陽翔投手
東北・ハッブス大起投手
修徳・篠崎国忠投手
高田・中山勝暁投手
神村学園・黒木陽琉投手
花咲徳栄・小野勝利内野手
＜大学生＞
東北福祉大・後藤凌寿投手
平成国際大・冨士隼斗投手
早大・熊田任洋内野手
早大・加藤孝太郎投手
明大・蒔田稔投手
法大・尾崎完太投手
立大・池田陽佑投手
立命大・谷脇弘起投手
同大・真野凜風投手
九州共立大・木村仁投手
日大・友田佑卓捕手
関大・有馬諒捕手
日体大・松浦佑星内野手
＜社会人＞
日本通運・平元銀次郎投手
セガサミー・古屋敷匠真投手
東芝・粂直輝投手
三菱重工West・竹田祐投手
ヤマハ・相羽寛太内野手
日本新薬・武田登生内野手
パナソニック・山本ダンテ武蔵外野手
