プロ野球のドラフト会議が２７日、東京都内のホテルで行われた。１位指名では「大学ビッグスリー」の藤岡貴裕投手（東洋大）がロッテ、楽天、横浜の競合となり抽選でロッテが交渉権を獲得、菅野智之投手（東海大）は巨人と日本ハムの重複となり、日本ハムが交渉権を得た。野村祐輔投手（明大）は広島の単独指名となった。通算７１本塁打の高校ＮＯ１野手、高橋周平内野手（東海大甲府）はオリックス、中日、ヤクルトの競合となり、中日が交渉権を得た。

　巨人は外れ１位で松本竜也投手（英明）を横浜との競合の末、交渉権を獲得した。

　２位指名では“下町のダルビッシュ”こと吉本祥二投手（足立学園）がソフトバンク、松本剛内野手（帝京）が日本ハム、歳内宏明投手（聖光学院）が阪神、中後悠平投手（近大）がロッテに指名された。

　日本ハムは５位で、２４日に都市対抗野球で大会史上５４年ぶりに完全試合を達成した森内寿春投手（ＪＲ東日本東北）、７位で早大ソフトボール部の大嶋匠捕手を指名した。