出場32校が決定し、九州は明豊、大分商の大分勢、創成館（長崎）、鹿児島城西（鹿児島）の4校が選ばれた。ダイエー、西武などで活躍した佐々木誠監督が指揮を執る鹿児島城西は春夏通じて初の甲子園切符をつかんだ。

◆明豊（大分＝2年連続4度目）

1999年（平11）に別府大付と明星の学校法人合併で発足した男女共学の私立校。野球部創部は別府大付時の52年。甲子園は春は4度目、夏6度の出場。主なOBに元阪神城島健司、ソフトバンク今宮健太ら。所在地は大分県別府市野口原3088。

◆大分商（大分＝23年ぶり6度目）

昨秋大分大会準優勝、九州大会準優勝。1917年（大6）開校の男女共学県立校。野球部創部は1921年で、甲子園出場は春が6度目、夏は15度出場。で過去最高成績は8強。主なOBは元巨人岡崎郁、西武源田壮亮、広島森下暢仁ら。所在地は大分市西浜4の2

◆創成館（長崎＝2年ぶり4度目）

昨秋長崎大会準優勝、九州大会4強。1962年（昭37）創立の私立校。野球部創部は62年。甲子園出場は春が4度目、夏は2度。最高成績は18年春の8強。主なOBは阪神川原陸、格闘家の広田瑞人、漫画家の鬼頭えんら。所在地は諫早市貝津町621

◆鹿児島城西（鹿児島＝初）

昨秋鹿児島大会準優勝、九州大会4強。ダイエー、西武などで活躍した佐々木誠監督が指揮を執る。1927年に設立された鹿児島和洋裁縫女学校が前身。その後鹿児島照国高等学校に改称。79年から現校名。春夏通じて甲子園初出場。主なOBに元DeNA細山田武史（現トヨタ自動車）、日本代表FWでブレーメンの大迫勇也ら。所在地は鹿児島県日置市伊集院町清藤1938