10月26日のドラフト会議で、2位以降のウエーバー方式の指名順について、シーズン順位が確定していない場合は前日25日までの順位が採用されることになった。

通常は日本シリーズ直前に行われるため、順位は確定している。だが新型コロナウイルスの感染拡大で開幕が遅れ、会議もシーズン終了前に前倒しになったため、会議までに全順位が確定しない可能性が高い。昨季から優先指名権は隔年で両リーグに順番に与えられるため、今ドラフト2位指名はパ・リーグ6位から始まり、3位指名は折り返しセ・リーグ1位の順になる。