<横浜2−1磐田>◇最終節◇2003年11月29日◇横浜国
3位につけていた横浜が、逆転で第2ステージを制覇した。横浜は第1ステージに続いての完全優勝で、95年以来2度目の年間王者に就いた。 横浜は首位の磐田との直接対決で、退場者を出し1人少ない状態ながら、1−1の後半ロスタイムに得点して逆転勝ちした。 勝てば優勝だった2位の鹿島は、ロスタイムでの失点で浦和に追いつかれ2−2で引き分け、目前で優勝を逃した。この結果、昨年の磐田の完全制覇に続き2年連続でチャンピオンシップは行われないことになった。