Ｊ１・Ｊ２入れ替え戦は１３日、磐田が１勝１分けでＪ１残留を決めた。Ｊ１のチームが入れ替え戦で残留を決めるのは０４年の柏以来４年ぶりとなった。過去の入れ替え戦の結果は以下。

　年度

　勝

　者

　第１戦

　第２戦

　敗

　者

　０８年

　磐田（Ｊ１・１６位）（１－１、２－１）仙台（Ｊ２・３位）

　０７年

　京都（Ｊ２・３位）

　（２－１、０－０）広島（Ｊ１・１６位）

　０６年

　神戸（Ｊ２・３位）

　（０－０、１－１）福岡（Ｊ１・１６位）

　０５年

　甲府（Ｊ２・３位）

　（２－１、６－２）柏

　（Ｊ１・１６位）

　０４年

　柏

　（Ｊ１・１６位）（２－０、２－０）福岡（Ｊ２・

　３位）

　※試合方式：ホームアンドアウェーで２戦を戦い、勝利数、得失点差が同じ場合はアウェーゴール数で勝者を決める。それでも決着しない場合は、第２戦の後に延長戦を行い、さらにＰＫ戦を行う。０６年の神戸は、アウェーゴール数で福岡を上回りＪ１昇格を決めた。