３回戦８試合が行われ、２大会ぶりの優勝を目指す東海大仰星（大阪第１）が４１－５で伏見工（京都）に快勝し、準々決勝に進出した。

　２連覇を狙う東福岡は長崎北陽台を２４－８で下し、１０大会連続の８強入り。

　石見智翠館（島根）は流通経大柏（千葉）とのシード校対決を２４－１９で制し、天理（奈良）は３１－２３で深谷（埼玉）を振り切った。記念枠で出場の京都成章（近畿）は１７－１５で国学院栃木に競り勝った。

　抽選の結果、３日の準々決勝は大阪桐蔭（大阪第２）－東福岡のほか、京都成章－東海大仰星、天理－桐蔭学園（神奈川）、関西学院（兵庫）－石見智翠館の組み合わせとなった。